Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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