Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCQ9H7C4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms