Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPAP3Q9H6T3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP3Q9H6T3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP3Q9H6T3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms