Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf49Q9H6J7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms