Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG10Q9H0Y0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG10Q9H0Y0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms