Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC113Q9H0I3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms