Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTMR12Q9C0I1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms