Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP44Q9C0F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms