Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP4Q9C0A0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP4Q9C0A0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms