Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM4Q9C037 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM4Q9C037 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms