Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF4Q9BZC1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF4Q9BZC1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms