Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
YTHDF1Q9BYJ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms