Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF4Q9BXJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF4Q9BXJ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms