Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RBM42Q9BTD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms