Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM29Q9BSF4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms