Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UTP23Q9BRU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UTP23Q9BRU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms