Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms