Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MGME1Q9BQP7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGME1Q9BQP7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms