Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL2Q99962 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms