Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms