Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms