Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms