Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA3Q96KX2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms