Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP3Q96JB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms