Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG1Q96JA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRIG1Q96JA1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms