Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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