Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP36Q96EU6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms