Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4CQ96DT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms