Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC11Q96DB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms