Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4CQ96CF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4CQ96CF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4CQ96CF2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms