Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP13Q92995 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP13Q92995 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP13Q92995 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP13Q92995 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP13Q92995 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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USP13Q92995 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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USP13Q92995 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP13Q92995 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP13Q92995 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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USP13Q92995 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP13Q92995 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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