Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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