Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms