Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF3Q8TEJ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF3Q8TEJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms