Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHDC9Q8NEP7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms