Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHBP1Q8NDI1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHBP1Q8NDI1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms