Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC155Q8N6L0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms