Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC33Q8N5R6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms