Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC2Q8N158 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC2Q8N158 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms