Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF444Q8N0Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF444Q8N0Y2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms