Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS3Q8IXF0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS3Q8IXF0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms