Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms