Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA4Q8IV77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA4Q8IV77 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms