Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLD3Q8IV08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLD3Q8IV08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms