Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC84Q86UT8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms