Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
PBRM1Q86U86 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PBRM1Q86U86 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PBRM1Q86U86 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms