Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APTXQ7Z2E3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms