Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD4Q76G19 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD4Q76G19 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms