Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRAMD4Q6IC98 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRAMD4Q6IC98 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms