Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARP1BQ659C4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP1BQ659C4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms